Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms