Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUCLG2Q96I99 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUCLG2Q96I99 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms