Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms