Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms