Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms