Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-CQ95604 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms