Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATA6Q92908 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms