Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C11orf40Q8WZ69 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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