Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms