Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFT2D1Q8WV19 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D1Q8WV19 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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