Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RHBDD1Q8TEB9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD1Q8TEB9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms