Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8N9G6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8N9G6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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