Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms