Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms