Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX29P2Q8IUI4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms