Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLRP9Q7RTR0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms