Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD2Q6P5Q4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms