Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms