Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CC2D1BQ5T0F9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms