Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HFEQ30201 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HFEQ30201 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HFEQ30201 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HFEQ30201 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HFEQ30201 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HFEQ30201 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms