Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms