Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF56Q15929 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms