Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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