Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMS2P11Q13670 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms