Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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