Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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