Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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