Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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MKRN4PQ13434 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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