Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSPB3Q12988 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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