Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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