Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIAQ12857 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIAQ12857 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIAQ12857 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIAQ12857 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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