Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms