Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN12Q05209 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms