Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OCA2Q04671 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OCA2Q04671 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms