Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAP1Q01518 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms