Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms