Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms