Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms