Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms