Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms