Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms