Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME5P56597 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME5P56597 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME5P56597 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME5P56597 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME5P56597 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME5P56597 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME5P56597 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME5P56597 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms