Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MANFP55145 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MANFP55145 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MANFP55145 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MANFP55145 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms