Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LUMP51884 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LUMP51884 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms