Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPC3P51654 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPC3P51654 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms