Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA1P49639 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA1P49639 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA1P49639 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA1P49639 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms