Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms