Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms