Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms