Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL3P36405 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms